日本脳炎の予防接種は、ワクチンを接種した後に重症ＡＤＥＭ（急性散在性脳脊髄炎）を発症した事例があったことから厚生労働省の通知を受け、平成１７年５月から積極的な勧奨を控えていましたが、現在は新しいワクチンでの接種を再開しました。
また、「勧奨差し控えによる未接種者への対応」が特例で定められ、次の方は日本脳炎の定期予防接種を受けることができるようになりました。

平成７年４月２日〜平成１９年４月１日生まれ

平成１９年４月２日〜平成２１年１０月１日生まれ（終了しました）